1988年起,初中成績評核試雖然名義上告一段落,但實則名亡實存。因當時大多數官津中學,仍為「非平衡班級」,即高中每級班數,較初中每級為少,通常是初中各級有6班甚至更多,高中各級只有4班,使中三升中四出現樽頸位。
以大多數中學的中三6班,中四4班而言,學生完成中三後,就鐵定有1/3成績較遜色的學生,在此樽頸位被淘汰。若被淘汰,仍須轉校升讀中四(但他校亦未必有學額)、或轉讀職業訓練技工課程、或離校就業,情況與初中成績評核試仍存在時,並無大改變。
約1990年代後期至2000年代初期,官津中學全面實施「平衡班級」,初中至高中各級班數相同,學生可能完成中三便被淘汰的情況才告消失,初中成績評核試才真正步進墳墓。